BとCは名前は同じだけど中身は違うんですよね？
BとCが同じクラス名なのでコンフリクトしてるんだと思います

BとCの共通部分を別のクラスとして抜き出し、それをドキュメントクラスにするのが素直な解決法です。

もしくは、単純にBとCの名前かパッケージ名を変えるんじゃ駄目なんでしょうか？

そもそも同じ名前の違うクラスがあるというのはよほどの理由がないかぎりさけた方がいいと思います。
ApplicationDomainを駆使すれば解決する可能性がありますが、緻密なクラス設計と運用ルールが必要になります。