Kamp10さんは、具体的にどういう構造でどういうスクリプトで実行されましたでしょうか。

私は最初は再現しなかったのですが、いろいろ設定を変えてやっているうちに再現する方法が見つかりました。
以下の２つのムービーを作ります。（WinでもMacでも起こります）

【読み込まれるムービー】
１）UIコンポーネントのButtonを１つだけ置いたswfを作る。仮にa.swfという名前にしておく。

【読み込む方のムービー】
１）読み込む場所になるムービークリップを２つ作り、それぞれaaa_mc、bbb_mcというインスタンス名をつけておく。
２）以下のスクリプトで２つのムービークリップにそれぞれswfを読み込む。
aaa.loadMovie("a.swf");
bbb.loadMovie("a.swf");

こうすると、読み込まれたswfのボタンをクリックするとそれぞれが選択されたように黄緑の線で囲まれました。swfを１つだけ読み込んだときは起こらないようですし、なんかUIコンポーネントのバグっぽい感じがしますね。

解決する方法ですが、偶然出なくなる方法を見つけました。
「読み込む方のムービー」でもUIコンポーネントのButtonを使ってやれば出なくなるみたいです。画面に配置してなくてもライブラリの中に持っているだけでも効果はあるみたいで、やっぱりバグっぽいですね。ただし、偶然見つけたのでこれで確実だという保証はありません。単なる私のカンです・・・

----------------
森　巧尚
http://www.ymori.com