お題を投稿したropi-pesoです。

同じような質問をマクロメディアに投げたところ、
当社では何事もなくうまく起動したという
血も涙もない返答が返ってきました。

憤慨した僕はなんとか自力で解決しなければと思い、
いろいろ試行錯誤していたところ、
Mac OS9側から、OSXを見たとき、
問題の外部オリジナルアプリケーションに
".app"の拡張子が！！

スクリプトを"アプリ名.app"としたところ、
うまく起動しました。

このapp拡張子はOSX上で見えず、名前を変更しても
必ず付いているみたいです。(winのexeみたいなもん？)
オリジナルプログラムだからかな?？

とにかく無事解決しましたし、
同じようなことで悩んでいる方がいたらいけないので、
ここに記しておきます。

お騒がせしました。