Fscommandのexecについては自由にアクセスできるのはFlash　Player5までしかサポートしてなかったように思います。

だから動きません。

http://www.macromedia.com/jp/support/flash/ts/documents/fl0266.html
に
fscommand("exec")を使用して起動する実行ファイルはプロジェクタと同階層にある fscommand というフォルダに存在していなければなりません。
とあります。
野中さんのリンク先にも説明があります。
maoh01_setup.exeをSWFがあるフォルダーの下に
fscommandというフォルダーを作ってそこにいれ

on (release) {
fscommand("exec", "fscommand/maoh01_setup.exe");
}
とすればよいはずです。

Flash5か4のプロジェクターで作成するかだと制限が無いです。
VBかdelphiなどでFlash.OCXを使ったものを作るかのも選択肢ではと思います。

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