kanaさんは書きました：
小さな円MCも大きな円MCも

onClipEvent (enterFrame) {
_rotation +=○○;
}

で回っています。
これをどっやって止めればいいのでしょうか？

アニメーションの処理に条件となる変数を設定し、その変数が特定の値のときのみアニメーションが実行されるようにスクリプトを作成します。このようなテクニックを、プログラミングの用語で「フラグ」を使った処理といいます。

kanakanaさんは書きました：
stopボタンには

on (release) {
　　if (flag == false) {
　　　this.daien._rotation = 0;//回転を止めるになってない
　　　frag = true;
　  } else {
　　　this.daien._rotaton += 15;//この処理も変ですね
　　　frag = false;
　　}
}

としました。

コメント行にも書きましたが回転を止めることになっていないので変な動きをします。

アニメーションの停止が課題です。

フラグは、信号機の役割をします。信号機が直接自動車や電車を停止できるのでしたら、信号機を設置する意味はありません。フラグのオン(青信号)/オフ(赤信号)と、それを見て実行されるアニメーションの処理とは独立しているからこそ、フラグが必要なのです。

kanakanaさんは書きました：

_root.clear();

を入れると動き始めても何も描いてくれません。
何が違うのでしょうか？

clear()すると、作っていたペン（太さ、色）までクリアしてしまったからですね。