またまた質問させてください。
flashでCD-ROMをオーサリングしなくてはいけないのですが、何か注意点とかありますでしょうか？

一昔前までCD-ROMはdirectorというのが定番でしたが、今はあまり差はないんでしょうか？

よろしくお願いします。

「一昔前まで」と「あまり差はない」と思います。

SWFムーピーのみで完結するコンテンツでしたら、問題ないでしょう。オペーレーティングシステム上の操作(フォルダを開くなど)や他のプログラム(Arobat Readerやメーラー)の起動といったことは、Flashプロジェクタの守備範囲を超えます(他言語やツールを使う対応策はありえます)。
引用：

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書き込みありがとうございます。

Arobat Readerを起動させてPDFを読ませたいのですが、ブラウザが立ち上がって、その中で展開するようですね。
アプリ単体の起動は難しいようですね。