みつもとじょうじさんは書きました：
数が少なかったうちは問題なく動作していたのですが、クラスの数（=ムービークリップの数）が増えてくると、思うように動作しなくなりました。
問題なのはおそらく自作クラスの継承で、確かではありませんが、どうも子クラスの定義が親クラスの定義より先に行われているのが原因ではないかと考えました。

Super_mcの1フレーム目
#initclip
//  SuperClassの定義
function SuperClass(){
    trace(["SuperClass", this]);  // 動作確認用
}

SuperClass.prototype = new MovieClip();

SuperClass.prototype.onLoad = function(){
    trace("ほげほげ");
}
Object.registerClass("Super_mc", SuperClass);
#endinitclip

Sub_mcの1フレーム目
// #initclip
#initclip 1
//  SubClassの定義
// function SuperClass(){
function SubClass(){	
    trace(["SubClass", this]);  // 動作確認用
}

// SuperClass.prototype = new SuperClass();  //  SuperClassを継承＜しない
SubClass.prototype = new SuperClass();

Object.registerClass("Sub_mc", SubClass);
#endinitclip

普通に SuperClass → SubClass と定義されれば、SuperClass の onLoad イベントハンドラメソッドがSubClass に継承され、Sub_mc がタイムライン上に配置された瞬間に「ほげほげ」と出力されるはずですが、もし SubClass → SuperClass と定義されていまえば、SubClass は何の機能も持たないことになります。（まさに現在この状態なのかもしれません）

書籍を漁ると、#initclip 1 と番号つけることで初期化される優先順位を決められることがわかりましたが、試しても、なんの変化もありませんでした。